Skyrius atlieka šias funkcijas:

• teikia savivaldybės  administracijos  direktoriui,  savivaldybės  biudžetinių ir viešųjų įstaigų vadovams objektyvią informaciją, rekomendacijas ir išvadas dėl audituotos įstaigos veiklos, vidaus kontrolės  būklės strateginių arba kitų veiklos planų, programų vykdymo, galimos arba nustatytos veiklos rizikos savivaldybės administracijos padaliniuose, savivaldybės biudžetinėse ir viešosiose įstaigose;
• tikrina  ir  vertina  savivaldybės  administracijos,  savivaldybės biudžetinių ir viešųjų įstaigų vidaus kontrolės sistemos funkcionavimą, rizikos veiksnių valdymo efektyvumą, strateginių ir kitų planų įgyvendinimą, veiklos atitiktį jų tikslams ir uždaviniams, turto apsaugą ir apskaitą, lėšų, gautų iš Europos Sąjungos, užsienio  institucijų  arba  fondų,  administravimą  ir  panaudojimą;
• atlieka Europos Sąjungos paramos  panaudojimo  privalomuosius  patikrinimus pagal Europos Komisijos reikalavimus.

Centralizuoto vidaus audito skyriaus vedėja Nijolė Samoškienė